La determinación de anticuerpos a la fracción microsomal de la glándula tiroides se usa para diagnosticar la tiroiditis autoinmune y el hipotiroidismo, en los que aumenta el nivel de anticuerpos en la sangre. Los anticuerpos contra los microsomas tiroideos forman complejos inmunes en la superficie celular, activan el complemento y linfocitos citotóxicos, lo que conduce a la destrucción celular y a la formación de un proceso inflamatorio en la glándula tiroides.