En la tuberculosis primaria, la lesión suele localizarse en los ganglios linfáticos, los pulmones, la pleura y, en ocasiones, en otros órganos: riñones, articulaciones, huesos y peritoneo. El área de inflamación específica puede ser muy pequeña y permanecer oculta durante la exploración. Si la lesión es grande, suele detectarse durante la exploración clínica y radiológica del paciente.