El agente causante de la peste es una varilla inmovilizada fija pequeña, polimórfica, Yersinia pestis de la familia Enterobacteriaceae del género Yersinia. Tiene una cápsula mucosa, no forma una espora. Facultativo anaeróbico Está coloreado con tintes de anilina bipolares (más intensamente alrededor de los bordes). Aísle las bacterias de la peste de rata, gusano de tierra, gopher, vuelo y arena.