El agente causal de la peste es Yersinia pestis, un pequeño bacilo polimórfico gramnegativo e inmóvil, de la familia Enterobacteriaceae, género Yersinia. Presenta una cápsula mucosa y no forma esporas. Es un anaerobio facultativo. Se tiñe con colorantes de anilina bipolares (con mayor intensidad en los bordes). Existen variedades de la bacteria de la peste en ratas, marmotas, tuzas, jerbos y campos.
