La causa exacta del desarrollo de cáncer de pene no se ha establecido completamente. Se sabe que el papel negativo desempeñado por la irritación crónica del esmegma prepucial la piel y productos de la descomposición bacteriana de las células epiteliales exfoliadas, por lo que en los hombres sometidos a la circuncisión, la probabilidad de desarrollar cáncer de pene es menor que la de los hombres con prepucio guardados.