Los síntomas de malabsorción de vitamina B12 se desarrollan a partir de los primeros meses de la vida del niño. Observan debilidad, palidez, retraso en el desarrollo físico, diarrea. Después de 6-30 meses después de la aparición de los primeros síntomas, se observan trastornos neurológicos: retraso mental, neuropatía, mielopatía.